2002年9月から、2003年9月のマイナーチェンジ頃まで販売された個体をフェーズ２と呼称します。
ここでは、このフェーズ２の個体について解説します。

※このほかのページ
■ フェーズ１・２・３の違い
■ フェーズ１
■ フェーズ２ （このページ）
■ フェーズ３
■ 特別仕様車

追記：
もし間違いや追加情報がありましたら遠慮なく指摘ください。
よろしくお願いします。

TSエンジンは、直噴ガソリンエンジンのJTSに変更されました。
直噴エンジン化によって、出力特性向上、有害排気物削減を狙ったのですが、新型エンジンゆえ初期ロットのJTSはあまり誉められたエンジンではありませんでした。音はうるさく振動は大きく、トルク特性もあまり良くありません。変更直後は、TSエンジンの良さが改めて指摘されていました。
しかし、月日が経つにつれてだんだんと熟成され、フェーズ３以降では安定したエンジンとなりました。直噴エンジン特有の粒子成分（黒煙）が目立つものの、トルク特性は明らかに向上し、振動も小さくなりました。

V6エンジンは、エンジン本体には手を加えず、エキマニの各バンクに１つずつ触媒が追加されました。
また、フロントパイプの集合部が、元々装着されていた触媒の後方に移動され、それと同時に触媒もそれぞれのフロントパイプへと移動しました。これで都合４つの触媒が装着されていることになります。
V6エンジンは元々の設計が古いこともあり、EURO2規制もぎりぎりでクリアされていたエンジンです。EURO3に対応させるには、さぞかし苦労したことでしょう。このおかげで、フェーズ１特有であった、エンジンの吹けの良さが多少薄れてしまいました。
この点も私がフェーズ１をオススメする理由の一つです。

なお、このモデルから導入されたスポーツレザーシートは、硬くて座れたものじゃありません。何人かのフェーズ２オーナーに話を聞きましたが、総じてとても不評です。
私もこのシートは嫌いです。できれば標準のモケットシートをおすすめします。

外装色は、フェーズ１後期と全く同じラインナップです。
若干の変更点として、ドアミラー（土台部分除く）およびバンパーモールが同色塗装されるようになりました。私の156と同じような外観です。

ここでは記載しませんが、この後に発売された156GTAも、内装・外装はこのフェーズ２に準じています。これは156がフェーズ３に以降した後も変更されず、同じままです。